Nutriop 长寿博客
表观遗传时钟作为年龄预测因子：它们的历史、优势和局限性
我们非常清楚，老年是癌症、心血管疾病和神经退行性疾病的主要危险因素。令人沮丧的是，由于预测患者生物衰老速度的工具可靠性较差，衰老研究的进展被推迟了很多年。为了更好地了解衰老过程并制定干预措施，抗衰老领域需要更有效的系统来测量生物年龄。 输入表观遗传时钟。这些基于 DNA 甲基化 (DNAm) 的年龄预测因子在过去十年左右的时间里逐渐受到重视，为更多定量研究铺平了道路。新的时钟和应用程序（包括取证）经常发布。它们代表了真正的突破，即使表观遗传时钟捕获的衰老的精确方面仍不清楚。让我们研究一下当今可用的一些表观遗传时钟，并总结它们的优点和缺点。因此，DNAm 已成为预测生物年龄的最有效的生物标志物之一。表观遗传时钟（也称为 DNAm 年龄预测因子）是使用随年龄变化的 CpG（DNA 区域）开发的。大多数时钟都是使用惩罚回归模型构建的，该模型有助于研究人员选择相关的 CpG 组。然后使用时钟根据关键 CpG 位点的甲基化百分比来估计实际年龄。改进和新发现正在迅速涌现。 年龄加速 让我们首先看看年龄加速，它指的是表观遗传年龄（eAge）和实际年龄（chAge）之间的差异。这与一些与年龄有关的状况有关。例如，患有肥胖症、唐氏综合症、亨廷顿舞蹈症、索托斯综合症和沃纳综合症的患者往往会表现出加速衰老的趋势。 eAge 加速也与身体和认知健康有关。表观遗传衰老率的变化因性别和种族背景而异。 维生素 D 充足的人的 eAge 加速度较低，白细胞端粒 (LTL) 较长。吸烟与气道细胞和肺组织的 eAge 升高有关（分别延长 4.9 和 4.3 年）。此外，研究人员还发现，怀孕期间吸烟可能会对后代的 eAge 产生不利影响。新的发现不断出现，但很明显，表观遗传时钟已经证明自己在预测生物年龄方面是准确的。 时钟设计的早期 与后来的版本相比，第一个表观遗传时钟在其训练数据集中包含相对较少的 CpG 位点和样本。早期研究人员利用 68 个样本（34 对双胞胎）创建了一个时钟，可以通过唾液预测年龄，平均准确度为 5.2 年。初步研究结束后，表观遗传时钟在样本、组织和 CpG 数量方面变得越来越复杂。 第一个多组织年龄预测器——Horvath 或泛组织时钟——使用了 353 个...
